必要性

SSLの為だとは思いますが、EC-CUBEではwwwの有り無しで購入出来なくなる、
といった問題があるので「301リダイレクト」を用いて解決します。
（※これに限らずURLは統一を心がけましょう。）

www無しに統一する例

RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www\.phono\.co\.jp
RewriteRule (.*) http://phono.co.jp/$1 [R=301,L]

www有りに統一する例

RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^\phono\.co\.jp
RewriteRule (.*) http://www.phono.co.jp/$1 [R=301,L]